《阿瑞斯病毒2》的故事发生在《阿瑞斯病毒》一代作品的五年之后，“蝗虫组织”通过生物学家掌握了阿瑞斯病毒的秘密，并凭病毒所带来的强大武力，对幸存者进行残酷压榨与掠夺。主角尼克将带领众人反抗“蝗虫组织”，重建属于自己的家园。