干禧年科技学院是基沃托斯三大学院之一，其理事会名为“研讨会”，C&C 女仆部负责维持秩序，工程部也名声在外。千禧年科技学院最关注的就是技术，基沃托斯的发明基本上都是出自她们之手，学院中的学生以理科生居多，而且不缺对学术比较关心的，但是对现实生活反而不太关心的怪异天才。
千禧学院中的角色有音濑小玉：这个角色是千禧年科技的黑客组织，真理社的黑客，擅长窃听别人的秘密，但是不会处理人际关系，如果对方比自己年纪小也会比较恭敬，比较难以亲近，属于在网络上很非常的能言善辩，但是现实中角色比较社恐的少女。
乙花堇是千禧年健身部的部长，这个角色一看建模就可以知道是有关非常热爱锻炼的运动型少女了，思想也是非常的单纯，任务世界上所有的问题都可以通过运动的方式来解决，虽然健身非常辛苦，但是为了这一刻，她还是可以忍耐的！
白石歌原是千禧年工程部的部长，这个角色的建模非常的独特，使用的武器扳手也是非常贴合工程部的形象，歌原发明了各种各样的机器人，尤其是它的小宠物【小雷】，在实际作战过程中有着超高的爆发力和伤害加成。
角楯花凛千禧年科技的秘密组织——C&C的特工，这个角色在游戏中是一个纯输出角色，攻击力在实战中那叫一个猛，虽然角色的立绘看起来有点咄咄逼人不好亲近的样子，但是在所有的cc特工中，这个角色的形势风格也是最为慎重的，在战斗中时常因为日奈的暴走而非常苦恼。
小涂真纪又一位作为千禧年科技的黑客组织——真理社的成员，这个角色的立绘可谓是非常的阳光活泼了，但是使用的武器一点都不逊色，是一个非常喜欢涂鸦的搞怪少女，整理社的徽章就是它的作品之一，但是因为这个角色对事情都不太重视，导致很多社团都不太喜欢它！
早濑优香在千禧年科技的理事会——“研讨会”中担任着会计要职。这个角色在游戏中的热度可谓热火朝天，最近也刚出了新的皮肤，这个角色是千禧科技中屈指可数的理科天才，主要是管理千禧年的各类预算，特产是使用算盘，每当思绪混乱的时候就会波动算珠的方式来平复自己的心情。游戏中的优香是一个输出型选手，其攻击力有渗透效果，可以对敌人造成破甲加成。
