《以撒的结合》并不遵循一般故事的叙事方法。它并没给我们一个清晰的解释，游戏的多个结局在多数玩家看来也几乎是随机而莫名的。为了理解故事，你必须自己拼凑线索。因此，这篇分析也可能存在谬误。
从表面上看，它可能像是个普通的搞笑独立游戏。游戏里的许多元素着实如作者所设计的一般荒谬至极，比如射烂大便来获取道具;尿自己一脸的BOSS;射出眼泪来攻击。不过《以撒的结合》在这黑色幽默之下，也有它严肃的一面。
从名字你可以看出，这游戏的主题是宗教。《以撒的结合》是一个圣经故事。故事里上帝命令亚伯拉罕牺牲自己的儿子以撒以表忠心(仅是试探)。这跟游戏剧情也有关联。游戏开局的旁白给我们讲述了以撒的妈妈如何听到“上帝的声音”，让她以同样的方式献上自己的儿子。不过不久后，当我们第一次打败妈腿的时候，我们却发现，“以撒的妈妈想杀他，却被上帝阻止”的情节是以撒在画中虚拟的。因为下一个场景我们就看到门的那边，他的妈妈仍然活着。
所以故事又有了新的悬念，我们并不知道以撒的妈妈是不是真的要杀了他。但是故事的第一部分显示，以撒一点都不喜欢他妈妈。他讨厌，甚至说是恨并害怕她。
以撒的结合圣水
于是这就是全部了吗?这是个玩家扮演以撒，在他想象的世界里与他妈妈战斗的游戏?
以撒的结合圣水
道具类型：被动道具
道具效果：生成一个小圣水瓶子跟随玩家，当角色受到伤害时，圣水瓶会被打碎，在地上形成一滩蓝色液体，
对经过的敌人(与柠檬事故的使用效果类似)造成8点伤害，在一段时间后消失，离开当前房间后瓶子会恢复原状;
如果玩家有其他小跟班，瓶子碎裂和恢复时会有部分跟班变身。
以撒的结合圣水
个人解析：以撒的结合圣水一个不受玩家待见的道具。
这个一个较为被动的道具，因为你只有受伤了以后才能起作用，而且实际效果也不是很好，这个东西的位置本来就很不好调整，杀伤范围还这么小，虽然伤害比较高，但很难伤到人，最重要的是每个房间只能用一次。
虽然以撒的结合圣水有一定的不足，但是如果玩家的技术真的够好，还是可以调整好圣水的位置，然后给自己带来大量的输出，伤害敌人的效果就会很明显的出来了。
